Situé à l'interface terre/mer, l'estuaire de la Vilaine constitue un écosystème très particulier où l'activité humaine est bien installée. Cet environnement est confronté à un envasement naturel qui, depuis la construction du barrage d'Arzal dans les années 1960-70, s'est accéléré de manière importante. Ce milieu riche en biodiversité est d'autre part soumis à des pressions anthropiques liées aux activités nautiques, touristiques et conchylicoles locales.
Pour comprendre de manière globale le fonctionnement de l'estuaire, plusieurs types d'outils (Systèmes d'Information Géographique (S.I.G.): logiciels de modélisation) et de données (Géophysique, carottes sédimentaires, photographies aériennes, images satellitaires, hydrologie...) sont accessibles. La mise en œuvre d'une réflexion visant à quantifier les facteurs de contrôle de l'envasement (vent, houle, marrées, débits fluviaux, flux sédimentaires...) est nécessaire à la compréhension de l'évolution morphosédimentaire de l'estuaire. Elle permettra de comprendre de quelles façons et à quelles échelles spatiales et temporelles (décennales, annuelles, saisonnières) agissent les forçages hydrodynamiques sur les caractéristiques physiques (transport de sédiments, évolution des vasières) et sur la qualité biologique de l'estuaire.
Ainsi un bilan passé, récent et futur, portant sur l'évolution et la fonctionnalité bioécologique et sédimentologique, sera développé pour être étendu à l'ensemble des estuaires sud-bretons.